Soweit ich weiß befindet sich in Gummibärchen wasserlösliche Gelantine. Deshalb könntest du die Gummibärchen in kochenden Wasser auflösen (Becherglas mit Deckel und Eis oben drauf).Damit hast du dann auch den Farbstoff mit anderen gelösten Stoffen zusammen. Da stellt sich die Frage, ob dann noch eine Trennung z.B. durch Dünnschichtchromatographie gemacht werden soll. Ein Problem könnte auch sein, dass die Gelantine beim Erkalten wieder ausfällt.

Hier ist das Experiment gut erklärt:

https://www.chemieunterricht.de/dc2/milch/v-farbe1.htm